名侦探柯南/主线剧情(38)

129.来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件
组织研究员，代号为Sherry的宫野志保因姐姐宫野明美被组织所杀，以停止APTX4869研究的方式表示抗议，结果被组织囚禁在瓦斯室。绝望的她服下了藏着的APTX4869想要自杀，没想到与新一一样没被毒死，反而身体缩小成儿童时期模样，得以挣脱手铐从垃圾信道逃了出来。
因为她之前已经从对新一家的调查中发现新一也变小了，所以她将新一作为了唯一可以理解她处境的人，于是就去寻找工藤新一。最后疲惫的她倒在新一家门口，被隔壁的阿笠博士所救。她向博士将自己的身份和盘托出，也就得以寄住在了博士家里，以一名转校生的身份成为了柯南的同班同学和少年侦探团成员，并拥有了“灰原哀”这个新名字。
博士收留灰原后，柯南也因此得知了导致他变小的药的名字和大概信息，不过灰原却暗示此药原本的用途不是毒药。另一边，琴酒他们还在加紧追查雪莉的下落，柯南与灰原也就从此卷入了对组织侦查与反侦察的大戏中。不过此时的灰原对组织有着极度的恐惧感，不愿透露更多组织的情报。
130-131.竞技场无差别胁迫事件
剧情本身与组织无关，但是灰原很莫名其妙地对柯南说过一句话，她说组织有一个始于半个世纪前的庞大计划，而柯南已经陷入了这个计划里了。但究竟是什么却不得而知。她肯定知道，但就是不说
后来又表示，“人是不能违逆时光洪流的”，仿佛暗示着组织的研究与违逆时光规律有关。
170-171.黑暗中的死角
米花高中校医新出智明的父亲被其继母杀害，破案后的剧情却突然犀利了起来。原来这是真正的新出智明在345集三方对决前唯一的一次出场，为保护无辜的女佣，警方修改的了案件的纪录，隐瞒了真实的作案手法，这一点只有真正的新出知道，而后来假扮新出的贝尔摩德只通过偷来的警方笔录知道了伪造的案情，所以这一点日后也被朱蒂用来指证贝尔摩德假扮的新出智明。此乃青山历时两年打造的一个大伏笔
其实这时候的新出只是帝丹高中篮球队的临时教练，真新出本来是要去青森的医院工作而不是当校医，贝尔摩德假扮成新出后为了调查新一才当上了米花高中的校医。这一点从《361帝丹高中的学校怪谈（前篇）》中的柯南的话可以得到佐证。
也在这一集里，因为新出智明和小兰的关系“亲密”，柯南醋缸翻了
176-178.与黑暗组织的再会