漩涡鸣人(12)

在寻找途中，鸣人等人遭到了晓组织的面具男阿飞的阻拦，众人的攻击对他无效，最终拖延到鼬和佐助对决结束后和绝一同离开，离开前自称为“宇智波斑”，先行带走了昏迷的佐助，任务以失败告终。

佩恩入侵

鸣人回到木叶，得知自来也被佩恩杀害的噩耗。为此曾一度悲伤的他，在伊鲁卡和鹿丸的鼓励下再度振作，并协助暗号班破译自来也留下的暗号。
为了变强对抗晓，鸣人前往妙木山修行仙术。不久后佩恩入侵木叶想要抓住身为九尾人柱力的鸣人，并对木叶村大肆破坏，得知鸣人不在村内后，佩恩使用了超大型的“神罗天征”将木叶几乎夷为平地。学成仙术后的鸣人回到了被破坏的木叶村，与佩恩六道展开战斗，由于学会仙术实力大增，螺旋手里剑的缺点也完全弥补，变得可以扔出，加上多位妙木山蛤蟆的协助，在天道因为使用了神罗天征力量没有恢复的时间里解决了多位佩恩，第五个佩恩饿鬼道也因为吸收了鸣人的仙术查克拉无法控制而蛙化，但面对恢复了力量的最强的天道，还是无法匹敌，鸣人被天道抓获，雏田为了保护鸣人挺身而出并向鸣人告白，但还是被佩恩击败，误以为佩恩杀死了雏田的鸣人情绪失控，在一瞬间爆发九尾查克拉，变成了六条尾巴的状态，天道一时间敌不过不得不使用了地爆天星抓住鸣人，却被鸣人变成第八条尾巴突破。
正当鸣人快要变成第九条尾巴时，波风水门留在鸣人体内的查克拉出现，制止了鸣人撕开封印。鸣人在水门口中得知了自己身世，水门在使用仅剩的查克拉重新修复了封印后消失，鸣人从地爆天星中脱离，以仙人模式和天道展开最后的较量，在使用了多重影分身加变化术的连续诱敌后，抓住了佩恩无法使用神罗天征的五秒空隙，以螺旋丸击败天道。并通过佩恩身上的查克拉接收器感知到了佩恩本体的所在地，见到了长门和小南。在了解了长门的身世后，两人就实现和平这一点展开了交流，最后长门被鸣人所打动，决定把实现和平的理想寄托在鸣人身上，以生命为代价使用了“外道·轮回天生之术”，复活了所有在这次的入侵中死去的人。回到村子的鸣人得到了全村人的认可，被当作英雄崇拜。

五影会谈

佐助在知道鼬的真相后与晓组织联手抹杀木叶高层，鸣人得知此事后想要阻止佐助，与卡卡西、大和一同前往铁之国，找到了准备参加五影会谈的雷影，请求雷影对佐助网开一面，但遭到了雷影的强烈抗拒。在旅馆住宿时，遇到了特意来找他的面具男，卡卡西和大和赶来包围了面具男后，鸣人激动的质问面具男对佐助有何企图，面具男便对鸣人等人说出了宇智波灭族事件的真相，并声称现在的佐助已经被仇恨所支配。