帝厉魔
三代终极BOSS,数码世界自诞生以来便一直处在数码死神严密的监视和控制之下,但是只有在数码世界的资料量过度膨胀并且所有抑制手段均以失败而告终时,它才会作为最后的终极措施直接干预数码世界并对其进行完全格式化。
六翅兽
四代终极BOSS,是被神所创造出来的,生来就有12枚翅膀的至高天使,堕落后被古代十斗士打败,将力量分给了三大天使,数码宝贝系列中最强大的数码兽之一。
世界树
五代终极BOSS,管理数码世界的主计算机,同时也被称为数码世界的神,可能由不明组织作为管理员进行控制,但也出现了拥有自我意识的行动,率领着皇家骑士。